树莓派指的是一款硬件开源的，树莓派是一个成品开发板，上面也有CPU、内存，但是它们都是以分立的芯片的形式存在，而且CPU性能远超单片机，可以运行Linux操作系统。单片机是一类芯片的总称，在一块芯片上集成了CPU，内存，Flash（类比电脑的硬盘，早期单片机是ROM）以及IO之类的外设，它不能运行Linux或者Windows这样的分时操作系统。单片机可以有十几路PWM，但是树莓派只有一个PWM。也有单片机不能做，但是树莓派能做的，比如拍500W像素的照片，运行minecraft等。
总的来说，树莓派自带完整的系统，功能完善扩展性强，成本相对较高；单片机则入门简单，成本划算，但功能单一，要实现一些功能需要很强大的技术能力。但随着硬件行业技术革新成本下滑，树莓派所代表的生态将是大势所趋。